O curso está estruturado em 3 anos, e as disciplinas são voltadas principalmente para a formação em Oncologia e suas subespecialidades. O curso de Pós-graduação em Oncologia segue as normas do MEC (Ministério da Educação) e também as diretrizes da CNRM (Comissão Nacional de Residência Médica). Portanto, o curso é realizado na modalidade Formação Profissional Especializada em Medicina. O curso é eminentemente prático, realizado em consultório hospitalar, acompanhado por preceptores especialistas e pelo coordenador do curso.